Nos encontramos en el siglo XXII, específicamente en el año 2100, época en la cual se ha logrado construir una colonia espacial en la Luna. En ésta se desarrolla un proyecto para investigar y explotar nuevas formas de energía más rentables. Kurau, hija del Dr. Hajime Amami, director científico del proyecto, se encuentra muy triste porque su padre no estará presente en la celebración de su 12º cumpleaños. Él decide invitarla a pasar un día con él en las instalaciones científicas, sin sospechar todo el caos y drama que iban a suceder. Luego de un accidente, Kurau deja de ser la chica alegre y extrovertida, convirtiéndose en alguien serena y fría, poseedora de extraordinarios poderes. Diez años después Kurau se ha convertido en una agente, llevando a cabo difíciles misiones de infiltración y espionaje en las cuales siempre resulta exitosa. Debido a esto, la G.P.O. (Global Police Organization) sospecha de ella e intenta capturarla, por todos los medios, debido a la "potencial amenaza" que su existencia significa. Es en esta dinámica de escape - persecución que se irán planteando nuevas preguntas y revelando secretos hasta entonces desconocidos. ¿Qué es Rynax? ¿Kurau sigue siendo humana? ¿La G.P.O. protege la seguridad mundial con buenas intenciones?
